El Gobierno Escolar es la máxima instancia de participación y toma de decisiones en la Institución Educativa. Es el mecanismo para garantizar la representación de toda la comunidad Educativa en la discusión y decisiones que afectan al colegio. La Comunidad Educativa son todas aquellas personas que afectan o son afectadas por el entorno educativo y está conformada por estudiantes, padres y madres, docentes, directivos docentes, administrativos y egresados.
Cada establecimiento educativo debe tener un Gobierno Escolar. Este será elegido los primeros sesenta días calendario, para un período anual. El Gobierno Escolar está conformado por el rector, el Consejo Directivo, el Consejo Académico, el Consejo Estudiantil, Personería, Contraloría, y el Consejo de madres y padres de familia.
El Gobierno Escolar fue establecido por la ley 115 de 1994 y reglamentado por el Decreto 1860 de 1994. Todos los miembros del Gobierno Escolar a excepción del rector son elegidos de manera Directa por los integrantes de cada estamento: Docentes, Estudiantes, Egresados, Madres y Padres de Familia.
El Gobierno Escolar es necesario para equilibrar el orden cotidiano del estudiantado pues lo convierte, en un agente activo y crítico forjador de costumbres ciudadanas y democráticas, además de darle la oportunidad que opine en su proceso de desarrollo estudiantil. La elección del Gobierno Escolar es el espacio propicio para poner en práctica los valores democráticos fundamentales, que permitan desarrollar una convivencia pacífica y de participación, en donde los estudiantes son agentes activos en la construcción de una sociedad más justa e igualitaria.